近日，中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院植物抗逆高效全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室楊淑華課題組在Cell雜志在線發(fā)表了題為A natural variant of COOL1 gene enhances cold tolerance for high latitude adaptation in maize的研究論文。該研究首次揭示了玉米適應(yīng)高緯度低溫環(huán)境的分子機(jī)制，發(fā)現(xiàn)玉米COOL1基因的自然變異通過(guò)增強(qiáng)低溫耐受性，促進(jìn)其適應(yīng)高緯度環(huán)境。這一發(fā)現(xiàn)彌補(bǔ)了關(guān)于玉米適應(yīng)高緯度低溫環(huán)境的知識(shí)空白，并為高緯度地區(qū)玉米的種植提供了新的分子育種策略。

　　玉米作為全球主要糧食作物，對(duì)溫度變化的敏感性非常高。提高玉米對(duì)溫度的適應(yīng)性，尤其是在低溫環(huán)境下的耐受能力，變得愈加重要。低溫不僅影響玉米的生長(zhǎng)和產(chǎn)量，還決定了其在全球不同地區(qū)的種植分布。因此，深入研究和利用玉米耐冷基因資源，對(duì)于培育適應(yīng)低溫環(huán)境的玉米品種具有重要的實(shí)際意義。

　　玉米起源于墨西哥西南部，并由其野生種大芻草馴化而來(lái)。盡管玉米的原產(chǎn)地為熱帶地區(qū)，但自哥倫布發(fā)現(xiàn)美洲之前，它便已經(jīng)傳播至溫帶地區(qū)，并且現(xiàn)如今廣泛種植于南緯40°至北緯58°之間的廣闊區(qū)域。玉米的適應(yīng)性不僅依賴于開(kāi)花時(shí)間的調(diào)控，還需要具備應(yīng)對(duì)高緯度和高海拔地區(qū)低溫環(huán)境的能力。雖然近年來(lái)關(guān)于玉米開(kāi)花適應(yīng)性的研究取得了顯著進(jìn)展，但其在高緯度低溫環(huán)境下的適應(yīng)機(jī)制仍知之甚少。

　　為鑒定調(diào)控玉米耐冷性的關(guān)鍵基因，楊淑華課題組利用205份玉米自交系群體進(jìn)行了全基因組關(guān)聯(lián)分析，成功在玉米第3號(hào)染色體上發(fā)現(xiàn)了一個(gè)調(diào)控玉米耐冷性的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子，命名為COLD-RESPONSIVE OPERATION LOCUS 1 (COOL1)。重測(cè)序和候選基因關(guān)聯(lián)分析表明，COOL1啟動(dòng)子區(qū)域的9個(gè)SNP與玉米自交系耐冷性顯著關(guān)聯(lián)。根據(jù)這些變異位點(diǎn)，將自交系分為HapA和HapB兩種單倍型，其中COOL1HapA的基因表達(dá)水平較低，并且其表現(xiàn)出更強(qiáng)的耐冷性;過(guò)表達(dá)COOL1基因會(huì)導(dǎo)致玉米耐冷性降低，而敲除COOL1則能夠顯著增強(qiáng)玉米苗期的耐冷性(圖1)。多組學(xué)分析顯示，COOL1通過(guò)直接抑制低溫關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子DREB1/CBF和海藻糖合成關(guān)鍵基因TPS的表達(dá)，負(fù)調(diào)控玉米的耐冷性。

圖1 COOL1基因負(fù)調(diào)控玉米耐冷性

　　進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)，COOL1啟動(dòng)子區(qū)的4個(gè)顯著自然變異位點(diǎn)位于A-box基序，這一基序受光信號(hào)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子HY5的調(diào)控。在低溫環(huán)境下，HY5表達(dá)水平顯著上升，通過(guò)抑制COOL1基因的表達(dá)，正向調(diào)控玉米的耐冷性。COOL1啟動(dòng)子的自然變異影響了HY5對(duì)其啟動(dòng)子區(qū)的結(jié)合能力，從而導(dǎo)致了COOL1HapA和COOL1HapB耐冷性差異。進(jìn)一步研究還表明，COOL1的蛋白穩(wěn)定性受到鈣依賴蛋白激酶CPK17的調(diào)控。低溫激活CPK17激酶活性，促使其從細(xì)胞質(zhì)進(jìn)入細(xì)胞核，磷酸化COOL1，從而增強(qiáng)COOL1蛋白穩(wěn)定性，負(fù)向調(diào)控玉米的耐冷性。

圖2 COOL1耐冷優(yōu)異等位基因促進(jìn)玉米對(duì)高緯度地區(qū)的適應(yīng)性

　　為了探究COOL1基因的進(jìn)化起源，研究團(tuán)隊(duì)對(duì)59種不同大芻草中COOL1啟動(dòng)子區(qū)域進(jìn)行了測(cè)序。結(jié)果顯示，超過(guò)一半的大芻草攜帶耐冷等位基因COOL1HapA，表明這一等位變異在野生種群體中就已存在。進(jìn)一步對(duì)1,008份前哥倫布時(shí)期遍布美洲大陸的玉米地方品種進(jìn)行基因分型，發(fā)現(xiàn)COOL1HapA耐冷等位基因主要分布于北部高緯度寒冷地區(qū)，并在北美地區(qū)固定，而COOL1HapB冷敏感等位基因則更常見(jiàn)于低緯度溫暖地區(qū)。這表明，COOL1的耐冷等位基因在促進(jìn)玉米適應(yīng)高緯度低溫氣候過(guò)程中起到了重要作用(圖2)。研究還指出，我國(guó)一些主栽玉米品種(如先玉335、鄭單958等)的部分親本攜帶COOL1冷敏感等位基因。值得一提的是，在正常環(huán)境條件下，COOL1功能缺失突變體的產(chǎn)量相關(guān)性狀并未表現(xiàn)出顯著變化。因此，COOL1耐冷等位基因在提升玉米耐冷性、拓展其高緯度種植范圍方面具有顯著的應(yīng)用潛力。

　　這項(xiàng)研究為玉米在高緯度寒冷地區(qū)的適應(yīng)性改良提供了新的分子育種策略，對(duì)全球玉米生產(chǎn)及氣候變化應(yīng)對(duì)具有重要的意義。

圖3 COOL1調(diào)控玉米耐冷性及高緯度適應(yīng)性的工作模型

　　生物學(xué)院植物抗逆高效全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室楊淑華教授是該論文通訊作者，博士后曾榕和施怡婷教授為第一作者。田豐教授對(duì)該研究工作提供大力指導(dǎo)和幫助，提出寶貴意見(jiàn)和材料支持，楊小紅教授、鞏志忠教授以及中國(guó)科學(xué)院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所左建儒研究員為該研究提供了重要材料及建設(shè)性意見(jiàn)。張曉燕副教授、郭麗博士、李卓洋博士、傅迪毅博士、博士生李岷澤以及作物功能基因組學(xué)與分子育種研究中心莊軍紅參與研究工作。中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)作物功能基因組學(xué)與分子育種研究中心為該研究提供遺傳轉(zhuǎn)化服務(wù)和重要轉(zhuǎn)基因材料，為項(xiàng)目的順利推進(jìn)奠定了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。該研究得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目、國(guó)家自然科學(xué)基金等項(xiàng)目的資助。